08 未開拓タンパク質データの収集・特徴抽出・予測

太田 元規

名古屋大学情報学研究科 教授

研究室HP

研究分担者福地 佐斗志

前橋工科大学 工学部

研究室HP

教科書的な翻訳ルールに従って生合成され,自発的に固い構造に折りたたまるという古典的描像の埒外にあるタンパク質が近年存在感を増している.ノンコーディングRNAや非典型的な翻訳機構に由来するタンパク質を対象とした予備解析では,それらの多くは比較的短い天然変性タンパク質であった.反復配列,低複雑性配列を含む天然変性タンパク質が翻訳後修飾などを契機として液-液相分離を引き起こして液滴を形成し,機能することも話題となっている.つまり本領域で解析対象とする未開拓タンパク質は,基本的には天然変性タンパク質だと考えられ,その構造・機能を理解するためには,対象となるデータを集めて編集し,情報解析する必要がある.申請者らはこれまでに天然変性タンパク質データベース:IDEALを構築・運用し,世界標準データベースに育て上げた.UniProt(タンパク質の配列と機能のデータベース)に登録されている未開拓タンパク質については,液滴形成や翻訳後修飾との関連などがわかるよう機能アノテーションを強化し,既存IDEAL を拡張する.ノンコーディングRNA や非典型的翻訳機構に由来するUniProt未登録の未開拓タンパク質は,それらを論文などから収集し,新規データベースを構築して統計解析を実施する.将来的には二つのデータベースを統合した新IDEALを開発し,データ解析による未開拓タンパク質の特徴抽出と予測法の確立を目指す.

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